Während seines Studiums war er Mitglied im Bundesjazzorchester unter der Leitung von Peter Herbolzheimer sowie in der Orchesterakademie des Schleswig-Holstein Musikfestivals 2005. Darüber hinaus trat er mit der Jungen Deutschen Philharmonie auf.

Fabian Becks derzeitige Tätigkeit als freiberuflicher Musiker umfasst sowohl Mitgliedschaften und Aushilfstätigkeiten in diversen Bigbands – darunter das Joe Haider Jazz Orchestra, die Eberhard Budziat Big Band und die Wednesday Night Big Band – als auch Engagements in zahlreichen Orchestern. So konnte er unter anderem in der Südwestdeutschen Philharmonie Konstanz und bei der Württembergischen Philharmonie Reutlingen Erfahrungen sammeln. Auch bei Ballettproduktionen am Nationaltheater in Mannheim sowie als Bühnenmusiker an der Staatsoper in Stuttgart war Fabian Beck tätig. Bei den Stuttgarter Musical-Produktionen, darunter Wicked, Tanz der Vampire, Rebecca und Chicago, war er viele Jahre regelmäßig zu hören. Kammermusikalisch spielt er unter anderem mit den Ensembles Blechlabor und Oz Brass.

Im pädagogischen Bereich ist Fabian Beck seit 2009 an der Musikschule Stuttgart als Lehrer für tiefes Blech angestellt.